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(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202111101567.4 (22)申请日 2021.09.18 (71)申请人 深圳市龙华区中心医院 地址 518000 广东省深圳市龙华区福城街 道观澜大道187号、 185-4号、 212号1-2 楼和松元围新围七巷1号2- 5楼 (72)发明人 陈鹏飞 高汉超 宋锦旗 林利忠 (74)专利代理 机构 深圳鼎合诚知识产权代理有 限公司 4 4281 代理人 周建军 彭家恩 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) G16B 20/50(2019.01) G16B 25/10(2019.01) A61K 45/00(2006.01)A61P 35/00(2006.01) (54)发明名称 生物标志物在制备或筛选结直肠癌诊断试 剂中的用途 (57)摘要 生物标志物在制备或筛选结直肠癌诊断试 剂中的用途, 生物标志物包含如下基因中的至少 一种: Hmgb1、 Slc12a2、 Krt15、 Krt8、 EphB2、 Lgr5、 E2F1、 CD133、 c ‑Myc、 Epcam。 本发明提供的生物标 志物可以用于对患者预后进行有效的监测预警。 权利要求书2页 说明书11页 序列表4页 附图2页 CN 113943801 A 2022.01.18 CN 113943801 A 1.生物标志物在制备或筛选癌症诊断试剂中的用途, 其特征在于, 所述生物标志物包 含如下基因中的至少一种: Hmgb1、 Slc12a2、 Krt15、 Krt8、 EphB2、 L gr5、 E2F1、 CD133、 c ‑Myc、 Epcam。 2.如权利要求1所述的用途, 其特征在于, 所述生物标志物包含如下基因中的全部: Hmgb1、 Slc12a2、 Kr t15、 Krt8、 EphB2、 Lgr5、 E2F1、 CD13 3、 c‑Myc、 Epcam。 3.如权利要求1所述的用途, 所述 生物标志 物包含待测样本中所述基因的表达水平; 和/或, 所述 生物标志 物包含待测样本中所述基因相对于参 考基因的相对表达水平; 和/或, 所述 参考基因包 含在细胞中组成型、 稳定表达的基因; 和/或, 所述 参考基因包 含内参基因; 和/或, 所述内参基因包 含Gapdh基因、 Acti n基因、 Tubulin基因中的至少一种。 4.如权利要求1所述的用途, 其特 征在于, 所述癌症包括结肠癌、 直肠癌中的至少一种。 5.如权利要求1所述的用途, 其特征在于, 根据待测样本中所述基因的相对表达量, 计 算风险值, 根据所述 风险值, 评估受试者复发的风险; 和/或, 根据所述 风险值与阈值的大小关系, 评估受试者癌症复发的风险; 和/或, 如果 风险值>阈值, 则预测为高风险, 如果 风险值≤阈值, 则预测为低风险; 和/或, 所述风险值=[RQ(Hmgb1)*RQ(Slc12a2)*RQ(Krt15)*RQ(Krt8)*RQ(EphB2)*RQ(Lgr5)*RQ(E2F1)* RQ(CD133)*RQ(c‑Myc)*RQ(Epcam)]/α, α 为非零常数, RQ表示对应基因相对于参考基因的相对表达 量; 和/或, RQ=2‑ΔΔCt, ΔΔCt=(待测样本中靶基 因PCR循环数 ‑参考基因PCR循环数) ‑(对 照样本中靶基因PCR循环数 ‑参考基因PCR循环数); 和/或, 所述PCR循环数 是通过实时荧 光定量PCR检测得到; 和/或, 所述 参考基因包 含内参基因和/或外参基因; 和/或, α 为1 1.16; 和/或, 所述待测样本包括肿瘤组织样本; 和/或, 所述对照样本包括 正常组织样本; 和/或, 所述 正常组织样本包括癌旁组织样本、 其 他正常的非癌旁组织样本 。 6.生物标志物在制备或筛选癌症治疗药物中的用途, 其特征在于, 所述生物标志物包 含如下基因中的至少一种: Hmgb1、 Slc12a2、 Krt15、 Krt8、 EphB2、 L gr5、 E2F1、 CD133、 c ‑Myc、 Epcam。 7.一种计算癌症风险值的方法, 其特 征在于, 包括: 表达量计算步骤, 包括计算靶基因 的表达量, 所述靶基因包含如下基因中的至少一种: Hmgb1、 Slc12a2、 Kr t15、 Krt8、 EphB2、 Lgr5、 E2F1、 CD13 3、 c‑Myc、 Epcam; 风险值计算 步骤, 包括 根据所述靶基因的表达量, 计算得到风险值。 8.一种用于预测癌症风险的装置, 其特 征在于, 包括: 表达量计算模块, 用于计算靶基因 的表达量, 所述靶基因包含如下基因中的至少一种: Hmgb1、 Slc12a2、 Kr t15、 Krt8、 EphB2、 Lgr5、 E2F1、 CD13 3、 c‑Myc、 Epcam; 风险值计算模块, 用于根据所述靶基因的表达量, 计算得到风险值; 判断模块, 用于根据所述 风险值, 预测受试者患 癌风险。 9.一种装置, 其特 征在于, 包括:权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 113943801 A 2存储器, 用于存 储程序; 处理器, 用于通过 执行所述存储器存储的程序以实现癌症风险预测, 预测方法包括: 表达量计算步骤, 包括计算靶基因 的表达量, 所述靶基因包含如下基因中的至少一种: Hmgb1、 Slc12a2、 Kr t15、 Krt8、 EphB2、 Lgr5、 E2F1、 CD13 3、 c‑Myc、 Epcam; 风险值计算 步骤, 包括 根据所述靶基因的表达量, 计算得到风险值; 判断步骤, 包括 根据所述 风险值, 预测受试者患 癌风险。 10.一种计算机可读存储介质, 其特征在于, 所述介质上存储有程序, 所述程序能够被 处理器执行以实现如权利要求7 所述方法或权利要求9中所述预测方法。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 113943801 A 3
专利 生物标志物在制备或筛选结直肠癌诊断试剂中的用途
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