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(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202111185498.X (22)申请日 2021.10.12 (71)申请人 南京融捷康生物科技有限公司 地址 211800 江苏省南京市江北新区探 秘 路73号树屋十六栋07栋 (72)发明人 苏志鹏 张云 王乐飞 孟巾果 (74)专利代理 机构 南京冠誉至恒知识产权代理 有限公司 32426 代理人 郭晓敏 (51)Int.Cl. C07K 16/28(2006.01) C07K 16/40(2006.01) C12N 15/13(2006.01) C12N 15/70(2006.01) C12N 15/85(2006.01)C12N 1/21(2006.01) C12N 5/10(2006.01) A61K 39/395(2006.01) A61P 35/00(2006.01) C12R 1/19(2006.01) (54)发明名称 针对EGFRvIII的单域抗体及其衍生蛋白和 应用 (57)摘要 本发明属于免疫学领域, 涉及针对EGF RvIII 的单域抗体及其衍生蛋白和应用。 所述的单域抗 体由重链构成, 重链包括重链CDR1、 重链CDR2和 重链CDR3; 所述的重链CDR1、 重链CDR2和重链 CDR3的氨基酸序列为 (1) — (7) 的序列组合或与 其同源性高的序列。 本发明使用生物基因工程技 术筛选出特异性针对EGF RvIII单域抗体, 这些抗 体初步亲和 力明显, 并且具有阻断特定细胞释放 细胞因子, 通过原核表达即具有良好的结合活 性, 具有一定的成药性。 权利要求书2页 说明书13页 序列表16页 附图5页 CN 114044826 A 2022.02.15 CN 114044826 A 1.针对EGFRvIII的单域抗体, 其特征在于: 所述的单域抗体由重链构成, 重链包括重链 CDR1、 重链CDR2和重链CDR3; 所述的重链CDR 1、 重链CDR2和重链CDR3的氨基酸序列为下述 (1) ‑(7) 的一种: (1) SEQ ID NO:40所示的CDR 1, SEQ ID NO:46所示的CDR2, SEQ ID NO:52所示的CDR3; (2) SEQ ID NO:40所示的CDR 1, SEQ ID NO:46所示的CDR2, SEQ ID NO:53所示的CDR3; (3) SEQ ID NO:41所示的CDR 1, SEQ ID NO:48所示的CDR2, SEQ ID NO:54所示的CDR3; (4) SEQ ID NO:43所示的CDR 1, SEQ ID NO:49所示的CDR2, SEQ ID NO:51所示的CDR3; (5) SEQ ID NO:40所示的CDR 1, SEQ ID NO:47所示的CDR2, SEQ ID NO:52所示的CDR3; (6) SEQ ID NO:40所示的CDR 1, SEQ ID NO:44所示的CDR2, SEQ ID NO:52所示的CDR3; (7) SEQ ID NO:42所示的CDR 1, SEQ ID NO:45所示的CDR2, SEQ ID NO:50所示的CDR3 。 2.根据权利 要求1所述的针对EGFRvIII的单域抗体, 其特征在于: 所述的单域抗体的框 架区FR的序列为下述 (a) ‑(i) 中的一种; (a) SEQ ID NO:21所示的FR1, SEQ ID NO:26所示的FR2, SEQ ID NO:34所示的FR3, SEQ ID NO:39所示的FR4, 或其变 体, 所述变 体在所述FR中包 含至多3个氨基酸的替换; (b) SEQ ID NO:24所示的FR1, SEQ ID NO:31所示的FR2, SEQ ID NO:37所示的FR3, SEQ ID NO:38所示的FR4, 或其变 体, 所述变 体在所述FR中包 含至多3个氨基酸的替换; (c) SEQ ID NO:25所示的FR1, SEQ ID NO:30所示的FR2, SEQ ID NO:36所示的FR3, SEQ ID NO:39所示的FR4, 或其变 体, 所述变 体在所述FR中包 含至多3个氨基酸的替换; (d) SEQ ID NO:23所示的FR1, SEQ ID NO:27所示的FR2, SEQ ID NO:32所示的FR3, SEQ ID NO:39所示的FR4, 或其变 体, 所述变 体在所述FR中包 含至多3个氨基酸的替换; (e) SEQ ID NO:21所示的FR1, SEQ ID NO:28所示的FR2, SEQ ID NO:34所示的FR3, SEQ ID NO:39所示的FR4, 或其变 体, 所述变 体在所述FR中包 含至多3个氨基酸的替换; (f) SEQ ID NO:21所示的FR1, SEQ ID NO:27所示的FR2, SEQ ID NO:34所示的FR3, SEQ ID NO:39所示的FR4, 或其变 体, 所述变 体在所述FR中包 含至多3个氨基酸的替换; (g) SEQ ID NO:23所示的FR1, SEQ ID NO:27所示的FR2, SEQ ID NO:33所示的FR3, SEQ ID NO:39所示的FR4, 或其变 体, 所述变 体在所述FR中包 含至多3个氨基酸的替换 (h) SEQ ID NO:22所示的FR1, SEQ ID NO:26所示的FR2, SEQ ID NO:34所示的FR3, SEQ ID NO:39所示的FR4, 或其变 体, 所述变 体在所述FR中包 含至多3个氨基酸的替换; (i) SEQ ID NO:22所示的FR1, SEQ ID NO:29所示的FR2, SEQ ID NO:35所示的FR3, SEQ ID NO:38所示的FR4, 或其变 体, 所述变 体在所述FR中包 含至多3个氨基酸的替换。 3. 根据权利要求1所述的针对EGFRvIII的单域抗体, 其特征在于: 所述针对EGFRvIII 的单域抗体与选自SEQ ID NO: 1‑10的氨基酸序列具有至少95%序列同源性, 并且能够特异 性结合EGFRvI II抗原。 4. 针对EGFRvIII的单域抗体, 其特征在于: 所述单域抗体分别如SEQ ID NO.1‑10所 示, 或者所述单域 抗体与SEQ ID NO.1‑10的氨基酸序列具有至少95%序列同源性。 5. 根据权利要求4所述的针对EGFRvIII的单域抗体, 其特征在于: 所述单域抗体的编 码序列分别如SEQ ID NO.11‑20所示, 或者与SEQ ID NO.11‑20具有至少95%序列同源性。 6.权利要求1 ‑5任意一项所述的针对EGFRvIII的单域抗体的Fc融合抗体或人源化抗 体。权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114044826 A 27. 一种编码权利要求1 ‑5任意一项所述的针对EGFRvIII单域抗体的核苷酸分子, 其特 征在于: 其核苷酸序列分别如SEQ ID NO: 11‑20所示, 或者与SEQ ID NO.11‑20具有至少 95%序列同源性。 8.一种表达载体, 其特征在于, 其包含编码权利要求1 ‑5任意一项所述的单域抗体或者 权利要求6所述的Fc融合 抗体的核苷酸分子或者权利要求7 所述的核苷酸分子 。 9.一种宿主细胞, 其特征在于, 其可以表达出权利要求1 ‑5任意一项所述的针对 EGFRvIII的单域抗体, 或其包 含权利要求8所述的表达载体。 10.权利要求1 ‑5任意一项所述的针对EGFRvIII的单域抗体在制备对表面含有 EGFRvIII蛋白的细胞进行内化的试剂中的应用; 或者, 权利要求1 ‑5任意一项所述的针对 EGFRvIII的单域抗体在制备抑制EGFRvI II基因表达的药物或抗肿瘤药物中的用途。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114044826 A 3
专利 针对EGFRvIII的单域抗体及其衍生蛋白和应用
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