(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210223386.7 (22)申请日 2022.03.09 (71)申请人 上海太和水 科技发展股份有限公司 地址 201501 上海市金山区枫泾镇 曹黎路 38弄19号1957室 申请人 上海海洋大学 (72)发明人 何文辉　张晟曼　何培民　谭梦　 (74)专利代理 机构 上海光华专利事务所(普通 合伙) 31219 专利代理师 王秋霞　许亦琳 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 大型溞鉴定用S SR标记组合及其用途 (57)摘要 本发明涉及浮游动物分子标记领域， 特别是 涉及培育种大型溞鉴定用SSR标记组合及其用 途， 所述培育种大型溞鉴定用SSR标记组合包括 以下中的一项或多项： ZSC_320、 ZSC_448、 ZSC_ 546、 ZSC_679、 ZSC_748、 ZSC_761、 ZSC_1372、 ZSC_ 1701、 ZSC_18335、 ZSC_875、 ZSC_1797、 ZSC_18 90、 ZSC_2050、 ZSC_2586、 ZSC_2799、 ZSC_2828、 ZSC_ 3113、 ZSC_3761、 ZSC_3833、 ZSC_4037、 ZSC_4319、 ZSC_10218、 ZSC_6980、 ZSC_7904、 ZSC_8717、 ZSC_ 9631。 本发明大型溞鉴定相关SSR标记可为评价 我国大型溞 品种遗传特征、 大型溞 品种鉴定等工 作提供理论依据和技 术手段。 权利要求书2页 说明书14页 序列表10页 附图1页 CN 114717325 A 2022.07.08 CN 114717325 A 1.一种培育种大型溞鉴定用SSR标记组合， 其特征在于， 所述培育种大型溞鉴定用SSR 标记组合包括以下中的一项或多项： ZSC_320、 ZSC_448、 ZSC_546、 ZSC_679、 ZSC_748、 ZSC_ 761、 ZSC_1372、 ZSC_1701、 ZSC_18335、 ZSC_8 75、 ZSC_1797、 ZSC_1890、 ZSC_2050、 ZSC_2586、 ZSC_2799、 ZSC_2828、 ZSC_3113、 ZSC_3761、 ZSC_3833、 ZSC_4037、 ZSC_4319、 ZSC_10218、 ZSC_ 6980、 ZSC_7904、 ZSC_8717、 ZSC_96 31； 其中， SSR标记ZSC_320的重复单 元为CAG， 重复次数为6； SSR标记ZSC_4 48的重复单 元为TTG， 重复次数为6； SSR标记ZSC_546的重复单 元为TGT， 重复次数为6； SSR标记ZSC_679的重复单 元为TTG， 重复次数为7； SSR标记ZSC_748的重复单 元为AAC， 重复次数为7； SSR标记ZSC_761的重复单 元为AAC， 重复次数为5； SSR标记ZSC_1372的重复单 元为GTT， 重复次数为7； SSR标记ZSC_1701的重复单 元为CAG， 重复次数为5； SSR标记ZSC_183 35的重复单 元为TC， 重复次数为7； SSR标记ZSC_875的重复单 元为ACC， 重复次数为5； SSR标记ZSC_1797的重复单 元为CAA， 重复次数为5； SSR标记ZSC_1890的重复单 元为CAA， 重复次数为5； SSR标记ZSC_20 50的重复单 元为TGC， 重复次数为6； SSR标记ZSC_2586的重复单 元为GCC， 重复次数为8； SSR标记ZSC_279 9的重复单 元为AGA， 重复次数为5； SSR标记ZSC_2828的重复单 元为AGA， 重复次数为5； SSR标记ZSC_31 13的重复单 元为AAG， 重复次数为5； SSR标记ZSC_3761的重复单 元为CAG， 重复次数为6； SSR标记ZSC_383 3的重复单 元为AAC， 重复次数为6； SSR标记ZSC_40 37的重复单 元为ACA， 重复次数为6； SSR标记ZSC_4319的重复单 元为CTT， 重复次数为7； SSR标记ZSC_10218的重复单 元为GTT， 重复次数为6； SSR标记ZSC_6980的重复单 元为ACA， 重复次数为6； SSR标记ZSC_7904的重复单 元为AAC， 重复次数为6； SSR标记ZSC_8717的重复单 元为GCC， 重复次数为6； SSR标记ZSC_96 31的重复单 元为CAG， 重复次数为6 。 2.根据权利要求1所述的培育种大型溞鉴定用SSR标记组合， 其特征在于， 所述培育种 大型溞鉴定用S SR标记组合 为鉴定待测大 型溞是否为太和水培 育种大型溞的SSR标记组合。 3.一组用于培育种大型溞鉴定的引物组， 其特征在于， 所述引物组包括用于检测权利 要求1或2所述培 育种大型溞鉴定用S SR标记组合的引物对。 4.根据权利要求3所述的引物 组， 其特征在于， 所述引物 组包括第 一引物对至第 二十六 引物对， 第一引物对至第二十六引物对的核苷酸序列如SEQ  ID NO:1～SEQ  ID NO:52所示。 5.一种用于培育种大型溞鉴定的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂盒包括权利要求3或4 所述的引物组。权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 114717325 A 26.根据权利要求5所述的试剂 盒， 其特征在于， 所述试剂 盒还包括用于从样品中提取基 因组DNA的试剂、 利用权利要求3或4所述的引物组进行PCR反应的试剂。 7.权利要求1或2所述的培育种大型溞鉴定用SSR标记组合、 权利要求3或4所述的引物 组、 权利要求5或6所述的试剂盒在鉴定培育种大型溞、 大型溞种群亲缘关系判断、 建立大型 溞辅助育种技 术平台、 选 育优质大 型溞品种 、 评价大型溞遗传特 征中的用途。 8.一种培育种大型溞的鉴定方法， 其特征在于， 所述鉴定方法包括用权利要求3或4所 述的引物组， 或用权利要求5或6所述的试剂盒检测待测大型溞的SSR标记， 根据 获得的SSR 标记信息确认待测大 型溞是否为培 育种大型溞。 9.根据权利要求8所述的鉴定方法， 其特 征在于， 还 包括以下步骤： 1)用权利要求3 ‑4任一所述的引物组以待测大 型溞的基因 组DNA为模板进行PCR扩增； 2)对PCR扩增产物测序， 测序结果包括待测大型溞的26个SSR标记的重 复单元和重 复个 数； 3)根据步骤2)获得的SSR标记的重复单元和重 复个数鉴定大型溞， 若SSR标记重 复单元 和重复个数均与权利要求1所述的SSR标记组合种各SSR标记的重复单元和 重复个数相同， 则判定待测大 型溞为培 育种大型溞， 否则， 则非培 育种大型溞。 10.根据权利要求9所述的鉴定方法， 其特征在于， 步骤3)还可以替换为计算待测大型 溞与培育种大型溞SSR标记组合的一致度P值判断待测大型溞是否为培育种大型溞； 一致度 P值的计算公式为P＝(m ‑n)/(m)*100％， 其中m为SSR标记的总个数， 即m＝26； n为待测大型 溞与培育种大型溞的SSR标记差异 位点数； 若一致度P＝100％， 则待测大型溞是培育种大型 溞； 若一致度P≠10 0％， 则待测大 型溞并非培 育种大型溞。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 114717325 A 3